您当前的位置: > 首页 > 近期课程 >

实用生物信息学研讨班

如您所知,近年来,以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助,如国家863计划、973计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心特此举办“实用生物信息学”培训研习班。
在线报名

主办单位:北京市计算中心

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地

北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地

 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:202010月19-23日  上午9:30-12:00   下午13:30-17:00

日期

主题

内容

第一天

生物信息学导论

1、生物信息学发展简史(重点讲解)

2、生物信息学主要研究领域(重点讲解)

3、生物信息学软件和工具概述

生物信息学基础

(上机操作)

1linux基础

掌握Linux系统下的常用命令(重点讲解)

掌握linux环境下软件的安装使用

了解shell脚本的编写

2、R基础

R语言概述

R包及使用规范

R基础数据结构

R进阶数据结构

R绘图

二代测序技术原理

1、介绍目前主流二代测序仪的测序原理

2、主要操作流程及特点

基因组重测序与数据分析

1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用

2、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识

基因组重测序数据分析实例(上机操作)

1、对二代测序数据的解读

2、数据质量控制及数据过滤

3、使用BWASamtools进行数据比对并对比对结果进行可视化(重点讲解)

4、寻找SNPIndel并进行注释(重点讲解)

5、寻找结构变异并对变异进行注释(重点讲解)

转录组测序与数据分析

1、转录组基本概况和技术发展简介

2、转录组技术流程及技术细节(重点讲解)

3、转录组应用案例

转录组数据分析实例(上机操作)

1、转录组数据准备和软件介绍及安装

2、转录组数据的比对(重点讲解)

3、表达量估计和分析(重点讲解)

4、后续功能分析简介

第四天

microRNA测序与数据分析

1microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义

2microRNA的生物学过程(重点讲解)

3microRNA的测序(重点讲解)

4microRNA测序数据分析软件(重点讲解)

5microRNA目前的挑战以及将来的研究前景

6microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)

7、近期文献

microRNA数据分析实例(上机操作)

1microRNA测序数据预处理(重点讲解)

2、测序数据长度分布计算

3microRNA的预测(重点讲解)

4microRNA碱基偏好性计算

5microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)

第五天

10×单细胞转录组测序数据常规分析流程介绍及上机操作

1、10×单细胞测序技术在科研领域的应用

2、10×单细胞实验建库原理介绍

3、10×单细胞转录组下机数据处理

4、10×单细胞软件Cellranger讲解及实操(重点讲解)

5、从单细胞表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操

蛋白结构与互作分析

PyMolCytoscape

 

注:课程以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:5400元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,免费提供工作午餐。

提供当期直播回放(北京市计算中心羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

注:凡9月开学季报名缴费者有机会获赠价值186元《高通量测序与高性能计算理论和实践》书籍一本。限量50本,先到先得。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

联系方式
韩老师 电话:13121228066 QQ:2596453578 邮箱:Haipinghan@bccac.cn

《实用生物信息学研讨班》报名表

培训班类型
姓名 性别
从事专业 职务
工作单位 住宿
通讯地址 邮编
电子邮件 手机
发票抬头 发票内容
备注

报名信息提交成功后一般两个工作日内会收到会务组邮件回复,如未按时收到信息请联系13121228066 (韩老师)确认。