日期 | 授课题目 | 授课内容 | 备注 |
第一天 | 基因组关联分析理论基础 |
1、基因组学与生物信息学概述 2、基于群体遗传的数据获取 3、基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍 4、常用GWAS数据库介绍 |
理论+ 操作(上机) |
GWAS计算机基础 |
1、Linux基础for GWAS 2、R基础for GWAS |
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Plink软件基础应用 |
1、Plink软件应用 2、Plink文件格式生成与解析 3、等位基因频率计算 4、哈-温平衡计算 5、基因组关联分析流程 6、关联分析结果分析与p校正 |
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第二天 | 基因型填充Imputation |
1、基因型填充Imputation的原理及应用 2、基因型填充软件介绍与应用 3、基因组填充的方法与分析流程 4、1000G数据应用 |
理论+ 操作(上机) |
关联分析应用 |
1、基于家系的关联分析 2、曼哈顿图的绘制与结果展示 3、实操for Plink |
理论+ 操作(上机) |
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第三天 | 关联分析应用 |
1、单倍型介绍 2、单倍型分析 3、LD连锁不平衡指数计算 4、实操 5、Tassel软件介绍 |
理论+ 操作(上机) |
韩老师 | 电话:13121228066 | QQ:2596453578 | 邮箱:haipinghan@163.com |